首先亲子鉴定不管是个人还是司法的，必须选择正规的鉴定机构才行。根据规定，亲子鉴定机构要经过省、直辖市审批，取得《司法鉴定许可证》，并且从事鉴定的人员也要有执业证书，目前深圳市具有法医物证鉴定资质的机构仅有4家。“而地下亲子鉴定处于管理真空，其出具的不准确报告可能破坏家庭的和谐稳定，并且还可能出卖客户隐私。
个人亲子鉴定采集样本的途径可以是多样化的，委托人可以来现场采样，也可以自行在家采样，也可以申请专业采样员上门采样。为了最大程度上保护自己的隐私，更多的委托人选择的是自行在家采样的方式。因此，在采样之前，委托人一定要事先掌握亲子鉴定的采样方法。
现在社会亲子鉴定的情况越来越多，在每年千余例亲子鉴定中，结果为非亲生的仅占5%左右。个人亲子鉴定的委托方主要集中在20岁-50岁，九成以上为男性。主要理由包括怀疑子女非亲生、抱错孩子，以及失散家庭成员认亲。
开展亲子鉴定业务的机构必须持有司法部门发放的《司法鉴定许可证》，且必须要有“法医物证鉴定”或“亲权司法鉴定”的业务范畴。目前，深圳只有DNA鉴定中心司法亲子鉴定机构具备亲子鉴定资质。
市面上有不少并不具备资质的机构，也非法开展亲子鉴定，有的宣称可“匿名鉴定”，无须提供证件，有样本就行。然而，与有资质的鉴定机构相比，这些非法鉴定存在很大隐患，准确性难保证，甚至可能出现夫妻双方各持一份截然相反的亲子鉴定书对簿公堂。更重要的是，拿到的只是一份检验报告，而非《司法鉴定意见书》，不具备结论有效性。
